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单细胞测序

解决方案

  • 服务介绍/

    INTRODUCTION

    艾名医学基于BD Rhapsody™单细胞平台和BD SeqGeq测序数据分析软件,可为客户提供从样本处理、全转录组分析(WTA)、下机数据到下游进阶的生信分析和数据解读的整体科研服务解决方案。此外,艾名医学还提供单细胞悬液质检、细胞上样率检测、细胞多态率检测、中间产物RPE Product浓度检测、文库质检等多个中间环节检测,分段质控可以降低成本,减少样本损失,为您的单细胞研究保驾护航。

    实验原理/

    EXPERIMENTAL PRINCIPLE

    BD Rhapsody单细胞平台

    服务流程/

    WORKFLOW

    转录组单细胞产品服务流程(20-25天)

    产品优势/

    PRODUCT ADVANTAGE

    收样类型/

    SAMPLE TYPE

    案例分享/

    CASE REPORT

    1.肾类器官与人胎肾单细胞比较

    本研究利用单细胞测序技术对人肾脏类器官和人类胎儿肾脏的单细胞数据集进行了综合分析,比较了两者组成细胞类型之间的异同,结果显示:两者在关键的间质、内皮细胞和肾细胞类型特异性标记上具有转录一致性[1]。

    2.单细胞测序表征肝胆肿瘤类器官的肿瘤内异质性

    本研究建立了了7个肝胆肿瘤类器官,并利用单细胞测序探索其异质性和进化。通过检测肿瘤干细胞标志物的表达模式,发现CD44阳性人群可能在HCC272中产生耐药性。UMAP和伪时间分析确定了肿瘤内的异质性和独特的进化轨迹,其中CTNNB1、GAPDH和NEAT1优势表达簇在肝胆类器官中普遍存在。CellphoneDB分析进一步表明:代谢优势类器官富集的缺氧信号上调了CD44亚群中NEAT1的表达,并通过Jak-STAT通路介导耐药[2]。

    Reference:

    1.Combes, Alexander N et al. “Single-cell analysis reveals congruence between kidney organoids and human fetal kidney.” Genome medicine vol. 11,1 3. 23 Jan. 2019, doi:10.1186/s13073-019-0615-0.

    2.Zhao, Yan et al. “Single-Cell Transcriptome Analysis Uncovers Intratumoral Heterogeneity and Underlying Mechanisms for Drug Resistance in Hepatobiliary Tumor Organoids.” Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) vol. 8,11 (2021): e2003897. doi:10.1002/advs.202003897.

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    浙江省杭州市滨江区江陵路88号万轮科技园10幢南座1层

    成都艾名迈德医学检验实验室有限公司
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